Работы 2-го этапа (2001-2002 гг) по теме «Исследование (на животных и человеке) механизмов действия СКЭНАР-терапии, поиск оптимальных режимов и местоположения электродов» явились развитием и логическим продолжением работ 1-го этапа (2000-2001 гг), посвященных выяснению действия СКЭНАР-стимуляции на активность коры и подкорковых структур мозга животных. В экспериментах на первом этапе работ автору удалось показать наличие выраженного центрального действия СКЭНАР-стимуляции на кору мозга и структуры гипоталамуса. Следующим же шагом явилось исследование центрального эффекта СКЭНАР-стимуляции на человеке — по показателям ЭЭГ и продолжение опытов на животных. В последних были подтверждены прежние данные о том, что основным центральным эффектом пролонгированной СКЭНАР-стимуляции является синхронизация альфаподобной активности мозга, сохраняющаяся и в последействии.

Актуальность исследования эффектов СКЭНАР-стимуляции определяется выявившимся в ходе лечебной практики необычайно широким диапазоном его оздоровительного действия. Автор предполагает, что СКЭНАР задействует некоторую общую систему организма, ответственную за его самовосстановление — систему «внутреннего доктора». В своих прошлых работах он пришел к выводу, что действие «внутреннего доктора» связано с процессами синхронизации медленноволновой электрической активности в структурах головного мозга и переходом работы висцерального мозга с режима мобилизации ресурсов, обеспечиваемого активацией симпатической вегетативной системы, системы бодрствования, в режим восстановления ресурсов при ведущей роли парасимпатической вегетативной системы. Исходя из этого, в качестве рабочей гипотезы об эффекте центрального действия СКЭНАР-стимуляции была принята та, что раздражение СКЭНАРом должно приводить к усилению синхронизации медленноволновой электрической активности коры мозга и гипоталамуса, где ведущую роль имеет его передний отдел. Целью исследований 2000г. было выяснение и интерпретация электрофизиологических эффектов СКЭНАР-стимуляции, которые можно было бы спроецировать для последующих в 2001г. исследований на человеке — по показателям ЭЭГ.